אלקטרופורזה של ג'ל לפוליאקרילאמיד (PAGE) יש מגוון רחב של ערך יישום במחקר ביולוגי וביוכימי, בעיקר בהיבטים הבאים:
הפרדה וזיהוי של חלבונים : PAGE מפריד בין דגימות חלבון באמצעות פעולת השדה החשמלי, מפריד אותן לפי הגודל והמטען של החלבונים, ואז מנתח אותן. ניתן להשתמש בשיטה זו כדי להפריד ולזהות רכיבי חלבון שונים בדגימות חלבון ולנתח את המשקל המולקולרי ומצב המטען של חלבונים.
ניתוח משקל מולקולרי חלבון ומצב מטען: PAGE יכול לנתח את המשקל המולקולרי ומצב המטען של חלבונים בהתאם למהירות הנדידה שלהם בשדה החשמלי. חלבונים מולקולריים גדולים נודדים לאט, חלבונים מולקולריים קטנים נודדים במהירות, חלבונים בעלי מטען חיובי נודדים אל הקתודה וחלבונים בעלי מטען שלילי נודדים אל האנודה.
זיהוי טוהר ותכולת החלבון: PAGE בשילוב עם צביעה או שיטות זיהוי אחרות יכול להמחיש להקות חלבון ולבצע ניתוח כמותי. ניתן להשתמש בשיטה זו כדי לזהות טוהר ותכולת החלבון.
זיהוי וכימות נוספים בשילוב עם שיטות אנליטיות אחרות: ניתן לשלב את PAGE עם שיטות אנליטיות אחרות כגון ספקטרומטריית מסה כדי לזהות ולכמת את החלבונים המופרדים. זה הופך את PAGE לבעל ערך במחקר פרוטאומיקה.
יישומי SDS-PAGE ו-Native-PAGE: בהתאם למטרת הניתוח, ניתן להפעיל את PAGE בתנאים דנטורטיביים או לא-. SDS-PAGE מבטל את ההשפעות המבניות והמטען של חלבונים באמצעות טיפול דנטורציה, ומאפשר להפריד אותם רק על סמך משקל מולקולרי; בעוד Native-PAGE שומר על מבנה-הסדר הגבוה יותר של חלבונים ומשמש בעיקר לניתוח המצב המקורי והאינטראקציות של חלבונים